Ein AFS-Formular kann durch anonyme oder identifizierte Benutzer verwendet werden. Die Identifikationsanforderung (keine, wahlweise, verpflichtend) wird je nach Formular festgelegt. Ist die Identität des Anwenders bekannt, werden dessen Daten im Formular vorbefüllt und spezifische Abschlüsse freigeschaltet (z. B. Absenden ohne Signatur).

AFS-Formulare können Identifikationsinformationen unterschiedlicher nationaler Systeme wie Bürgerkarte (AT), Handysignatur (AT), Portalverbund 1.0 (AT), Unternehmensserviceportal (AT), SuisseID (CH) und li-sign/lilog (FL) übernehmen. Für Anwendungsfälle mit niedrigen Sicherheitsanforderungen stellt AFS mit MTAN-Verfahren und Mailbestätigung niederschwellige „Identifikations“-Mechanismen bereit. Auch Open ID Identifikationen, wie zum Beispiel Google ID, werden unterstützt.